Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Capn3Q64691 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Capn3Q64691 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Capn3Q64691 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn3Q64691 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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