Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf4Q64287 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irf4Q64287 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms