Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phc1Q64028 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms