Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vat1Q62465 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms