Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Six3Q62233 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Six3Q62233 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Six3Q62233 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms