Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssr4Q62186 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssr4Q62186 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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