Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sema3cQ62181 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms