Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sema3bQ62177 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms