Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SelplgQ62170 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SelplgQ62170 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SelplgQ62170 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SelplgQ62170 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SelplgQ62170 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms