Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Odf1Q61999 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms