Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itm2aQ61500 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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