Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PcolceQ61398 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PcolceQ61398 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PcolceQ61398 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PcolceQ61398 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PcolceQ61398 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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