Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcd2Q61285 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcd2Q61285 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms