Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lama5Q61001 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Lama5Q61001 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lama5Q61001 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms