Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JrkQ60976 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms