Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms