Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot7Q60809 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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