Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf3Q60803 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms