Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2cQ60772 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn2cQ60772 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms