Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stxbp3Q60770 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Stxbp3Q60770 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms