Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf4Q60722 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms