Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms