Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms