Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brip1Q5SXJ3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms