Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme4Q5SSW2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme4Q5SSW2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms