Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TefmQ5SSK3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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