Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5431Q5NCB3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5431Q5NCB3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms