Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm12253Q5NC48 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms