Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DroshaQ5HZJ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DroshaQ5HZJ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms