Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Frem3Q5H8B9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Frem3Q5H8B9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Frem3Q5H8B9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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