Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q5EBG8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms