Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afap1l2Q5DTU0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afap1l2Q5DTU0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afap1l2Q5DTU0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms