Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chsy3Q5DTK1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms