Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Syce1lQ5D525 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Syce1lQ5D525 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms