Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ndufaf2Q59J78 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms