Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eme2Q56A04 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms