Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rtl6Q505G4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rtl6Q505G4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rtl6Q505G4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rtl6Q505G4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rtl6Q505G4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rtl6Q505G4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rtl6Q505G4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rtl6Q505G4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rtl6Q505G4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl6Q505G4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl6Q505G4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rtl6Q505G4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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