Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pdp2Q504M2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pdp2Q504M2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdp2Q504M2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pdp2Q504M2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pdp2Q504M2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pdp2Q504M2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Pdp2Q504M2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdp2Q504M2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms