Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc27a5Q4LDG0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc27a5Q4LDG0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc27a5Q4LDG0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a5Q4LDG0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms