Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syne3Q4FZC9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syne3Q4FZC9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms