Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Krtap1-4Q3V2D6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms