Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc110Q3V125 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms