Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms