Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930596D02RikQ3V0H9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms