Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3V0E1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3V0E1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms