Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zmat1Q3V0C1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms