Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms