Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm6Q3UZD5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm6Q3UZD5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Prdm6Q3UZD5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm6Q3UZD5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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