Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnpc3Q3UZ01 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms