Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc160Q3UYG1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc160Q3UYG1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms